หน่วยรับรองระบบงาน (Accreditation body : AB) มีหน้าที่ให้การรับรองระบบงานแก่หน่วยรับรอง (Certification Body : CB) ที่ให้การรับรองผู้ประกอบการในด้านต่างๆ เช่น การรับรองผลิตภัณฑ์ (Product Certification) การรับรองการบริหารงานคุณภาพ (Quality Management System Certification) การรับรองระบบการจัดการสิ่งแวดล้อม (Environmental Management System Certification) การรับรองระบบงานด้าน GMP/HACCP, ด้านการปฏิบัติทางการเกษตรที่ดี (Good Agricultural Practice : GAP), ด้านเกษตรอินทรีย์ (Organic Agriculture) เป็นต้น

             การดำเนินงานในฐานะหน่วยรับรองระบบงานให้เป็นที่ยอมรับและมีความทัดเทียมกับหน่วยรับรองระบบงานของต่างประเทศ ตลอดจนมีความเชื่อมั่นในระบบการรับรองของประเทศไทยนั้น การสมัครเป็นสมาชิกในองค์กรระดับสากล เช่น Pacific Accreditation Cooperation : PAC เป็นกิจกรรมหนึ่งที่ทำให้ระบบการตรวจสอบรับรองจะได้รับความเชื่อมั่นและการยอมรับในระดับสากลและจากประเทศคู่ค้า โดยเฉพาะในด้านสินค้าเกษตรและอาหาร ทำให้สินค้าของไทยที่ได้รับการรับรองเป็นที่เชื่อถือของประเทศคู่ค้าและก่อให้เกิดการขยายตัวของการส่งออกสินค้าได้มากยิ่งขึ้น รวมถึงการอำนวยความสะดวกในการค้าสินค้า ลดการตรวจสอบซับซ้อน